Uji In Silico Aktivitas Antikanker Kolorektal Senyawa Annomuricin terhadap Reseptor Epidermal Growth Factor Receptor (EGFR)

Annisa Meilani, Hilda Aprilia Wisnuwardhani, Taufik Muhammad Fakih

Abstract


ABSTRACT: Colorectal cancer is cancer that grows in the colon (large intestine) or in the lower colon that is connected to the rectum. Anticolorectal Cancer activity is found in the soursop plant (Annona muricata) which contains annomuricin compounds. The EGFR receptor is a receptor that plays an important role in anticancer activity. The purpose of this study was to prove based on in silico study whether the annomuricin compounds could be used as a anticancer candidate. The identification of the physicochemical properties of annomuricin compounds was carried out using ChemBioDraw 2D software. The annomuricin compound was optimized using Gauss View software version 5.0.8 and Gaussian version 09. Then proceed to the docking simulation to EGFR receptor which has been separated from its natural ligand validation of molecular docking system was carried out using MGL Tools 1.5.6 software which has been equipped with Autodock Tools version 4.2. The result showed that annomuricin D compound had a better affinity than the other four annomuricin compounds to EGFR. The annomuricin D compound obtained a bond free energy value of -7.23 kcal/mol and the value of the inhibition constant (Ki) was 5.01 µM. According toxicity test results, annomuricin D has a high potential for toxicity, with a low risk of exposure and does not cause carcinogenicity or mutagenicity. The annomuricin D compound is not better than its natural ligand gefitinib. Where the natural gefitinib has a free energy value of -8.95 kcal/mol and an inhibition constant (Ki) of 0.275 µM. It can be concluded that the annomuricin D test compound cannot be used as a colorectal anticancer candidate, because it does not have anticancer activity.

Keywords : Colorectal Cancer, EGFR, Annomuricin, In Silico.

ABSTRAK: Kanker kolorektal merupakan kanker yang pertumbuhannya terjadi di kolon (usus besar) atau di usus besar bagian bawah yang terhubung ke rektum (anus). Senyawa antikanker kolorektal ditemukan dalam tanaman sirsak (Annona muricata) yang mengandung senyawa annomuricin. Reseptor EGFR adalah reseptor yang berperan penting dalam antikanker kolorektal. Tujuan dilakukannya penelitian ini untuk membuktikan secara in silico senyawa annomuricin dapat dijadikan sebagai kandidat antikanker kolorektal. Pada penelitian ini dilakukan identifikasi sifat fisikokimia pada senyawa annomuricin menggunakan software ChemBioDraw 2D. Senyawa annomuricin dilakukan optimasi menggunakan software Gauss View versi 5.0.8 dan Gaussian versi 09. Kemudian dilanjutkan ke tahap simulasi docking senyawa uji annomuricin terhadap reseptor EGFR yang telah dipisahkan dengan ligan alaminya dan telah di validasi menggunakan software MGL Tools 1.5.6 yang telah dilengkapi dengan Autodock Tools versi 4.2. Berdasarkan hasil penelitian, hasil docking senyawa annomuricin D memiliki afinitas yang lebih baik dibandingkan keempat senyawa annomuricin lainnya. Senyawa annomuricin D diperoleh nilai energi bebas ikatan yaitu -7.23 kcal/mol dan nilai konstanta inhibisi (Ki) 5.01 µM. Hasil prediksi toksisitas annomuricin D memiliki potensi toksisitas yang tinggi, dengan resiko paparan yang rendah serta tidak menyebabkan karsinogenik atau mutagenisitas. Senyawa annomuricin D tidak lebih baik dibandingkan ligan alaminya. Dimana ligan alami gefitinib memiliki nilai energi bebas ikatan yaitu -8.95 kcal/mol dan nilai konstanta inhibisi (Ki) 0.275 µM. Maka dapat disimpulkam bahwa senyawa uji annomuricin D tidak dapat dijadikan sebagai kandidat antikanker kolorektal, karena tidak memiliki aktivitas antikanker.

Kata Kunci: Kanker Kolorektal, EGFR, Annomuricin, In Silico.


Keywords


Kanker Kolorektal, EGFR, Annomuricin, In Silico.

Full Text:

PDF

References


Artinda, S. A. (2016). Kajian Docking 3-[(Asetiloksi)Metil]-7-[(4-Hidroksi-3-Metoksifenil)Metilidin]Amino]-8-Okso-5-Thia-1-Azabisiklo[4.2.0]Oct-2-Ene-Asam Karboksilat Menggunakan Dock6. Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Surakarta

Bi, Hui-Min; Hu, Jun-Ping; You, Fu-Ying; Gao, Meng-Meng; Dong, Chun-Hua. (2014). QSAR Studies of Biological Activity with Phenylpropyl Aldehyde Thiosemicarbazone Compounds. Asian Journal Of Chemistry

Dany, P.; Lattimer, J. M.; Prakash, M.; Steiner, A. W. (2013). Stellar Superfluids. Inspire INT-PUB-009

Global Cancer Observatory. (2020). Source : Globocan 2018. World Health Organization. http://gco.iarc.fr

Hardjono, S. (2013). Sintesis dan uji aktivitas antikanker senyawa 1-(2-klorobenzoiloksi)urea dan 1-(4-klorobenzoiloksi)urea. Berkala Ilmiah Kimia Farmasi, 2 (1). pp. 16-20. ISSN 2302-8270

Jamaluddin, M. (2015). Efikasi dan Toksisiti Erlotinib/Gefitinib Sebagai Terapi Lini Kedua Pada Pasien Kanker Paru Jenis Karsinoma Bukan Sel Kecil. Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, Jakarta

Johan, A. K. (2016). Uji In Silico Genistein Sebagai Ligan Pada Reseptor Estrogen Alfa. Fakultas Farmasi, Universitas Sanata Dharma, Yogyakarta

Kementerian Kesehatan RI. (2015). InfoDATIN Stop Kanker. In infodatin-Kanker

Kementerian Kesehatan RI. (2016). Panduan Penatalaksanaan Kanker Kolorektal. Kementerian Kesehatan Republik Indonesia

Li; Qian-Shu; Xu, Xiu-Dong; Zhang S. (2003). Predicting Energies and Geometries for Reaction Inloved in Atmosphere Chemistry: A Comparison Study Between Hybrid DFT Methodes. J. Chem. Phy

Majhi, M.; Ali, M. A.; Limaye, A.; Sinha, K.; Bairagi, P.; Chouksey, M.; Shukla, R.; Kanwar, N.; Hussain, T.; Nayarisseri, A.; & Singh, S. K. (2018). An In Silico Investigation of Potential EGFR Inhibitors for the Clinical Treatment of Colorectal Cancer. Current Topics In Medicinal Chemistry.

Moghadamtousi, S.Z.; Fadaeinasab, M.; Nikzad, S.; Mohan, G.; Ali, H.M.; & Kadir, H.A. (2015). Annona muricata (Annonaceae): A review of its traditional uses, isolated acetogenins and biological activities. In International Journal of Molecular Sciences.

Prasetiawati, R.; Suherman, M.; Permana, B.; Rahmawati. (2021). Molecular Docking Study of Anthocyanidin Compounds Against. Indonesian Journal of Pharmaceutical Science and Technology Vol. 8 No.1

Rampado, R.; Crotti, S.; Caliceti, P.; Pucciarelli, S.; & Agostini, M. (2019). Nanovectors Design for Theranostic Applications in Colorevtal Cancer. In Journal of Oncology.

Ruswanto; Mardhiah; Mardianingrum, R.; & Novitriani, K. (2015). Sintesis dan Studi In Silico Senyawa 3-Nitro-N`-[(Pyridin-4-YL)Carbonyl] Benzohydrazide Seabagai Kandidat ANtituberkulosis. STIKes Bakti Tunas Huasada

Singgih, M.; Permana, B.; Maulidya, S.A.I.; Yuliana, A. (2019). Studi In Silico Metabolit Sekunder Kapang Monascus sp. Sebagai Kandidat Obat Antikolesterol dan Antikanker. Alchemy Jurnal Penelitian Kimia

Suryawinata, A. & Sukohar, A. (2016). Potensi Annonaceous acetogenins dari Sirsak (Annona muricata) sebagai Agen Kemoterapi melalui Induksi Apoptosis dan Inhibisi HIF-1. Fakultas Kedokteran, Universitas Lampung

Syahputra, G.; Ambarsari, L.; Sumaryada, T. (2014). Simulasi Docking Kurkumin Enol, Bisdemetoksikurkumin Dan Analognya Sebagai Inhibitor Enzim 12-Lipoksigenase. Jurnal Biofisika 10(1): 55-67

Tamba, Ernawaty. Karsinogenesis Kanker Kolorektal, Hubungannya dengan Diet dan Mikroflora Usus. Ilmu Kesehatan Masyarakat Fakultas Kedokteran, Universitas Kristen Krida Wacana.

Nuraeni Anisa Dwi, Lukmayani Yani, Kodir Reza Abdul. (2021). Uji Aktivitas Antibakteri Propionibacterium acnes Ekstrak Etanol dan Fraksi Daun Karuk (Piper sarmetosum Roxb. Ex. Hunter) serta Analisis KLT Bioautografi. Jurnal Riset Farmasi, 1(1), 9-15.




DOI: http://dx.doi.org/10.29313/.v0i0.29152

Flag Counter