Uji Senyawa Proantosianidin Daun Matoa terhadap Reseptor Hiv-1 Integrase Secara In Silico

Gheavanya Azhari Tamim, Anggi Arumsari, Amir Musadad Miftah

Abstract


Abstract. HIV-1 Integrase is an enzyme involved in the replication cycle of the retrovirus. This research aims to prove activity proanthocyanidin compound to inhibition HIV-1 Integrase by in silico and compare with raltegravir compound which is commercially available  and used clinically to find compound has the best anti-HIV activity.The method used is  molecular docking in a way docking proantosianidin compound and raltegravir compound with HIV-1 Integrase macromolecule, the next is toxicity test both compounds. Research result obtained proanthocyanidin coumpound which has the best anti-HIV activity compared to that raltegravir compound because it has a bond free energy value (∆G) and a smaller inhibition constant (KI). The smaller values of ∆G and KI then a compound has better afinitiy. Proanthocyanidin compounds have lower levels of toxicity than raltegravir compound because they are negative for carcinogenic and genotoxic. 

Keywords: HIV-1 Integrase, Proanthocyanidin, in silico

Abstrak. HIV-1 Integrase merupakan suatu enzim yang terlibat dalam replikasi retrovirus sehingga enzim ini dapat dijadikan sebagai target yang layak dalam pengobatan anti-HIV. Penelitian ini bertujuan untuk membuktikan aktivitas senyawa proantosianidin terhadap penghambatan HIV-1 Integrase secara in silico dan membandingkan dengan senyawa raltegravir yang sudah tersedia secara komersil dan digunakan secara klinis untuk menemukan senyawa yang memiliki aktivitas anti-HIV yang paling baik. Metode yang digunakan adalah molecular docking dengan cara mendocking senyawa proantosianidin dan senyawa raltegravir dengan makromolekul HIV-1 Integrase yang selanjutnya dilakukan uji toksisitas dari kedua senyawa tersebut. Hasil penelitian yang diperoleh yaitu senyawa proantosianidin merupakan senyawa yang memiliki aktivitas anti-HIV lebih baik dibandingkan dengan senyawa raltegravir karena memiliki nilai energi bebas ikatan (∆G) dan konstanta inhibisi (KI) lebih kecil. Semakin kecil nilai ∆G dan KI maka suatu senyawa memiliki afinitas yang lebih baik. Senyawa proantosianidin memiliki tingkat toksisitas yang lebih rendah dibandingkan senyawa raltegravir karena negatif terhadap karsinogenik dan genotoksik. 

Kata Kunci: HIV-1 Integrase, Proantosianidin, in silico


Keywords


HIV-1 Integrase, Proanthocyanidin, In Silico

Full Text:

PDF

References


Frengki., Saura, E. R., & -, R. (2013). STUDI INTERAKSI KURKUMIN-ARTEMISIN DAN TURUNANNYA TERHADAP RESEPTOR SARCOENDOPLASMA RETICULUM Ca+2 SECARA IN SILICO. Jurnal Medika Veterinaria.

Agistia Dany Dwi, Hari Purnomo, Maulana Tegar, A. E. N. (2013). No Title. INTERACTION BETWEEN ACTIVE COMPOUNDS FROM Aegle Marmelos CORREA AS ANTI INFLAMMATION AGENT WITH COX-1 AND COX-2 RECEPTOR, 18(2), 80–87.

Faustina, F. C., & Santoso, F. (2014). Extraction of Fruit Peels of Pometia Pinnata and Its Antioxidant and Antimicrobial Activities. J. Pascapanen.

Hutapea, H., & Oktavian, A. (2013). Kloning Fragmen DNA Pengkode Integrase ( int ) HIV ( Human Immunodeficiency Virus ) 1 Pada Escherichia Coli JM109. April, 59–65.

Marzouk, M. M. (2016). Flavonoid constituents and cytotoxic activity of Erucaria hispanica (L.) Druce growing wild in Egypt. Arabian Journal of Chemistry.

Munhoz, V. M., Longhini, R., Souza, J. R. P., Zequi, J. A. C., Mello, E. V. S. L., Lopes, G. C., & Mello, J. C. P. (2014). Extraction of flavonoids from Tagetes patula: Process optimization and screening for biological activity. Brazilian Journal of Pharmacognosy.

Muttaqin, F. Z. (2019). STUDI MOLECULAR DOCKING, MOLECULAR DYNAMIC, DAN PREDIKSI TOKSISITAS SENYAWA TURUNAN ALKALOID NAFTIRIDIN SEBAGAI INHIBITOR PROTEIN KASEIN KINASE 2-α PADA KANKER LEUKEMIA.

Muttaqin, F. Z., Andriani, R., & Damayanti, S. (2014). Analisis In Silico Genistein Dan Analognya Sebagai Inhibitor Kanker Payudara Reseptor Estrogen Alfa Positif (Erα+). Jurnal Farmasi Galenika.

Nugraha, B. D. (2010). It’s All About Sex A-Z tentang Sex.

Ruswanto, R., Mardhiah, M., Mardianingrum, R., & Novitriani, K. (2015). Sintesis Dan Studi in Silico Senyawa 3-Nitro-N’-[(Pyridin-4-Yl) Carbonyl]Benzohydrazide Sebagai Kandidat Antituberkulosis. Chimica et Natura Acta, 3(2).

Suhud, F., Siswandono, S., & Budiati, T. (2017). Sintesis dan Uji Aktivitas Senyawa 1-Benzil-3-benzoilurea Tersubstitusi Bromo, Kloro, Floro dan Triflorometil pada posisi para sebagai Agen Antiproliferatif. Media Pharmaceutica Indonesiana (MPI).

Syahputra, G., Ambarsari, L., & Sumaryada, T. (2014). Simulasi Docking Kurkumin Enol , Bismetoksikurkumin Dan Analognya Sebagai Inhibitor Enzim12-Lipoksigenase. Jurnal Biofisika.

Trickey, A., May, M. T., Vehreschild, J. J., Obel, N., Gill, M. J., Crane, H. M., Boesecke, C., Patterson, S., Grabar, S., Cazanave, C., Cavassini, M., Shepherd, L., Monforte, A. d. A., van Sighem, A., Saag, M., Lampe, F., Hernando, V., Montero, M., Zangerle, R., … Sterne, J. A. C. (2017). Survival of HIV-positive patients starting antiretroviral therapy between 1996 and 2013: a collaborative analysis of cohort studies. The Lancet HIV.

Wang, Q., Jin, J., Dai, N., Han, N., Han, J., & Bao, B. (2016). Anti-inflammatory effects, nuclear magnetic resonance identification, and high-performance liquid chromatography isolation of the total flavonoids from Artemisia frigida. Journal of Food and Drug Analysis.

Yuliyanasari, N. (2017). Global Burden Desease – Human Immunodeficiency Virus – Acquired Immune Deficiency Syndrome ( Hiv-Aids ). Qanun.




DOI: http://dx.doi.org/10.29313/.v6i2.23027

Flag Counter    Â